Kierownik tematu

Prof. dr hab. Leon Bobrowski

Cel realizacji zadania

Rozwijanie i implementacja nowych technik eksploracyjnej analizy danych (ang. data mining) i rozpoznawania obrazów (ang. pattern recognition) oraz ich zastosowania w analizie wybranych zbiorów danych biomedycznych.

Planowane efekty naukowe i praktyczne

Opracowywane będą narzędzia metody analizy dużych, wielowymiarowych zbiorów danych biomedycznych. Szczególna uwaga zostanie zwrócona na metody odkrywania wzorców w genetycznych zbiorach danych, które charakteryzują się dużą liczbą cech (genów) oraz małą liczbą obserwacji (pacjentów).

Przeprowadzona zostanie analiza statystyczna wybranych, publicznie dostępnych, danych mikromacierzowych o ekspresji genów, z uwzględnieniem niejednorodności składu komórkowego badanych próbek tkanek nowotworowych.

Kontynuowane będą prace dotyczące projektowania modeli prognostycznych na bazie wielowymiarowych zbiorów danych w oparciu o badanie liniowej separowalności zbiorów. Zagadnienie projektowania modeli prognostycznych liniowej separowalności obejmuje problem wyboru zestawów zmiennych prognostycznych z dużego zestawu zmiennych niezależnych oraz pozwala na uwzględnianie cenzorowanych wartości zmiennej zależnej. Zagadnienia tego typu analizowane są zwykle w ramach metod analizy przeżycia (ang. survival analysis).

Kontynuowane będzie gromadzenie oraz analiza zbiorów danych związanych z realizacją zadania badawczego pt.: “Roczny profil hemoglobiny we krwi w 20 różnych regionach Polski.  “Dołek” profilu HGB u młodych kobiet ciężarnych.”

Rozwijana będzie współpraca z Karolinska Institute w Sztokholmie (Center for Molecular Medicine, Karolinska

Institutet, Stockholm, Sweden) w zakresie zastosowania nowych technik eksploracyjnej analizy danych do analizy

klinicznych zbiorów danych fizjologiczno- genetycznych związanych z ostrymi stanami zapalnymi nerek. Prace ta mają na celu m.in. wydobywanie wzorców w postaci takich zestawów badań laboratoryjnych oraz zestawów genów, które pozwalają wspomagać diagnostykę i terapię pacjentów związanych z ostrymi stanami zapalnymi nerek.